Setiap mahluk hidup pasti mempunyai penyakit begitu juga dengan perkutut. Penyakit yang menyerang perkutut sebenarnya tidak banyak kurang dari sepuluh jenis penyakit. Cara terbaik untuk menghadapi serangan penyakit adalah melakukan pencegahan, yaitu dengan pemberian pakan dan air minum yang bergizi dan bersih, penjagaan kebersihan sangkan dan lingkungan, serta pengupayaan diterima sinar matahari secara cukup. Jika dirawat dengan baik, sebenarnya perkutut jarang sakit.
Jenis penyakit yang sering terjadi pada perkutut di antaranya :
- Pilek atau influenza
- Masuk angin
- Mencret, berak kapur
- Keracunan pakan
- cacingan
